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Informatica e non solo

SeqAnt: web service per identificare ed annotare variazioni alle sequenze del DNA

Posted by hosiris su ottobre 16, 2010

L’enorme uso e il basso costo delle piattaforme di sequenziamento di seconda generazione, permettono ai ricercatori e ai genetisti di tenere traccia di moltissime variazioni presenti sul DNA.
I metodi esistenti per annotare queste variazioni usano sistemi informativi troppo lenti per essere usati da un grande numero di sistemi di sequenziamento.
SeqAnt è un web service open source che rapidamente annota le variazioni delle sequenze nel DNA umano, di topi, farfalle e vermi. Le variazioni vengono catalogate in base alla funzionalità, alla frequenza e alla possibilità di conservazione evolutiva.

FONTE: www.biomedcentral.com
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