.: HosiriS :.

Informatica e non solo

Un modello di flusso basato sull’informazione con dissipazione, saturazione e direzione per l’inferenza del percorso attivo

Posted by hosiris su maggio 29, 2010

I sistemi biologici elaborano l’informazione genetica e i segnali ambientali attraverso “percorsi”. Il metodo di mappatura di questi percorsi in maniera sistematica ed efficiente a partire dalla genomica e dai dati della proteomica è un problema aperto. Metodi precedenti progettare euristica diversa ma non descrivono in modo esplicito i comportamenti del flusso di informazioni.
In questo studio vengono proposti nuovi concetti di dissipazione, di saturazione e di direzione per decifrare i comportamenti del flusso di informazioni in percorsi e in tal modo per dedurre i percorsi biologici da una determinata origine alla sua destinazione. Questo modello prende in considerazione, in modo esplicito, le caratteristiche comuni della trasmissione di informazioni e fornisce un quadro generale per modellare i percorsi biologici. Può integrare i diversi tipi di interazioni bio-molecolari per dedurre i percorsi di trasduzione del segnale. Il modello è formulato come un problema di programmazione lineare e quindi viene risolto in modo efficiente. Esperimenti su dati reali di lievito indicano che i percorsi riprodotti sono estremamente coerenti con le conoscenze attuali.

Fonte: www.biomedcentral.com
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